采用無土栽培發(fā)生的主要傳染病害有白粉病,、腐霉菌,、疫霉菌根腐病、白粉病,、霜霉病,、蔓枯病、蔓割病,、菌核病,、病毒病等。非傳染病害主要是無土栽培管理跟不上,，可能發(fā)生缺素癥,。防治無土栽培時發(fā)生的病害，應貫徹排除病害,、避開病害及利用病害三原則,。
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1,、種子消毒：種子可利用干熱滅菌，如70-72℃處理3天或用53-55℃溫湯浸種20-30分鐘或用次氯酸10-100 倍液浸種60分鐘,，皆可清除種子上的病原菌,。
2、營養(yǎng)液槽和工具消毒：用75%酒精或高錳酸鉀50-100倍液消毒營養(yǎng)液槽及工具,，防止病原菌存活留下隱患,。
3、棚室和設備的消毒：種植前,，溫室,、大棚內(nèi)外要清除所有的植物殘體，地面鋪上潔凈的塑料薄膜隔離土壤,?？臻g消毒可在大棚內(nèi)均勻放置3-4 只大口瓶,，倒入高錳酸鉀和甲醛，每立方米空間用高錳酸鉀4克,、甲醛4克,，大棚密閉24小時后通風，待藥劑揮發(fā)干凈后再種植,。栽培設施和器具的消毒,，可用中性次氯酸鈣1000倍液浸泡或流動沖洗1-2 天。消毒用過的殘液可排到溫室地面或周圍土壤作為環(huán)境消毒,。設施器具消毒后,，要用清潔的水沖洗掉殘液，以防藥害,。
4,、營養(yǎng)液的消毒：營養(yǎng)液可采用物理、化學或殺菌劑處理等方法進行消毒殺菌,。物理方法主要有過濾,、紫外線滅菌、超聲波處理,、巴氏德滅菌等,；化學方法主要有臭氧處理、表面活性劑及農(nóng)藥等,。
5,、操作人員的清潔衛(wèi)生：操作人員進出大棚或溫室時，要先在門口的消毒槽中浸有消毒液的泡沫墊上踩一踩,。選用84消毒液或0.3%漂白粉,，消毒液至少每周添加一次，同時還要告誡有關人員不能在水池中用營養(yǎng)液洗手等,。